直接在临床分离的多重耐药菌中进行功能基因组学研究是解析耐药机制以及开发抗耐药策略最直接有效的方法。然而，由于缺乏能在临床耐药菌中直接进行高效基因编辑的工具，目前耐药机制仍主要是采用组学分析加在模式菌中的异源验证进行研究。近日，中国科学院微生物研究所向华团队和香港大学闫爱新团队合作，报道了在临床多重耐药铜绿假单胞菌中开发基于内源性I-F型CRISPR的、高效简便的基因编辑系统，并在该系统的辅助下，实现了在临床多重耐药菌株自身遗传背景下耐药机制的原位解析和抗耐药化合物的筛选。该研究首次利用内源性I-F型CRISPR系统实现了对多重耐药菌的基因编辑，由于I-F型CRISPR系统普遍存在于多重耐药的铜绿假单胞菌中（70%），这将为临床耐药菌的研究提供高效、简便的基因编辑方法和一种原位耐药性解析的新策略。此外，该研究对临床多重耐药菌的耐药机理进行了解析并发现了该菌对阳离子拟态类小分子的伴随性敏感现象。这一新发现将为解决临床抗耐药应用提供新的思路和手段。

Zeling Xu, Ming Li, Yanran Li, et al. Native CRISPR-Cas-Mediated Genome Editing Enables Dissecting and Sensitizing Clinical Multidrug-Resistant P. aeruginosa. Cell Reports, 2019.

DOI: https://doi.org/10.1016/j.celrep.2019.10.006

https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2211124719312999?via%3Dihub