所有的病毒都需要策略来抑制或逃避它们感染的细胞的免疫途径。感染细菌的病毒(噬菌体(phages))必须避免针对核酸的免疫途径,如CRISPR Cas和限制性修饰系统,以有效地复制。近日,美国加州大学旧金山分校Joseph Bondy-Denomy课题组,发现噬菌体类核结构可保护自身DNA不受CRISPR核酸酶降解。研究人员发现,巨型噬菌体ΦKZ通过构建蛋白核样区域,将其DNA与宿主铜绿假单胞菌的免疫核酸酶分离。ΦKZ对体内靶向DNA的多种免疫机制具有抵抗力,包括CRISPR–Cas3,Cas9,Cas12a的两种亚型以及限制性酶HsdRMS和EcoRI。Cas蛋白和限制性内切酶在整个感染过程中均无法接近噬菌体DNA,但通过对EcoRI在区域内进行重新定位,可以靶向噬菌体并保护宿主细胞。此外,ΦKZ对Cas13a(一种靶向RNA的CRISPR-Cas酶)敏感,可能是由于噬菌体mRNA定位于细胞质。总体而言,研究人员认为,假单胞菌巨型噬菌体通过在其基因组周围组装蛋白质屏障来逃避广谱靶向DNA的核酸酶。
Senn D. Mendoza, Eliza S. Nieweglowska, Sutharsan Govindarajan, et al. A bacteriophage nucleus-like compartment shields DNA from CRISPR nucleases. Nature, 2019.
DOI: 10.1038/s41586-019-1786-y
https://www.nature.com/articles/s41586-019-1786-y