Nature Biotechnology:小分子生物活性表征的新技术
先知报道 先知报道 2020-05-21

小分子一般通过其化学结构进行比较,但没有统一的分析框架来表示和比较其生物活性。有鉴于此,西班牙巴塞罗那科技研究所Miquel Duran-Frigola等研究人员,开发了一项新技术,可用于表征小分子化合物的生物活性。

 

本文要点

1研究人员报道了化学检查器(CC),它提供了约800,000个小分子的生物活性数据。从化合物的化学性质到临床结果,CC将数据分为五个级别,每个级别的复杂性不断提高。

2在两者之间,它包括靶标、脱靶标、网络和细胞级信息,例如组学数据、生长抑制和形态。生物活性数据以矢量格式表示,将化学相似性的概念扩展到生物活性标记之间的相似性。

3研究人员展示了CC特征如何协助药物开发任务,包括靶标鉴定和文库表征。研究人员还验证了在单独使用化学信息无法解决的情况下如何来发现化合物。

综上所述,CC特征有助于将生物活性数据转换为可用于机器学习的格式。

 

                                             

 

参考文献:

Miquel Duran-Frigola, et al. Extending the small-molecule similarity principle to all levels of biology with the Chemical Checker. Nature Biotechnology, 2020.

DOI:10.1038/s41587-020-0502-7

https://www.nature.com/articles/s41587-020-0502-7


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