驱动基因的体细胞突变可能最终导致癌症的发展。因此，了解体细胞突变如何在癌症基因组中积累以及产生体细胞突变的潜在因素对于开发新的治疗策略至关重要。有鉴于此，美国德克萨斯大学MD安德森癌症中心的P. Andrew Futreal等研究人员，研究发现癌症基因组中的体细胞突变分布随三维染色质结构而变化。

本文要点

1）为了解空间基因组组织与特定突变过程之间的相互作用，研究人员分析了来自42种不同人类癌症类型的3,000个肿瘤-正常对全基因组数据集。

2）分析表明，癌症基因组中体细胞突变负荷的变化与拓扑相关域边界共同定位。与复制时序测量相比，域边界构成了更好的指标来跟踪突变负载变化。

3）研究人员表明不同的突变过程导致不同的体细胞突变分布，其中某些过程在活性域中生成突变，而其他过程在非活性域中生成突变。

本文研究表明，三维基因组组织与主动突变过程之间的相互作用对人类癌症中观察到的大规模突变率变异具有重大影响。

参考文献：

Kadir C. Akdemir, et al. Somatic mutation distributions in cancer genomes vary with three-dimensional chromatin structure. Nature Genetics, 2020.

DOI：10.1038/s41588-020-0708-0

https://www.nature.com/articles/s41588-020-0708-0