G-四链体是一种具有多种生物学功能的非经典核酸二级结构。发现G-四链体相关蛋白对理解G-四链体在生物中的功能非常重要。有鉴于此,武汉大学的周翔等研究人员,利用光活化的G-四链体配体成功实现了在细胞环境中以超高序列兼容性识别多种G-四链体相关蛋白。
本文要点
1)研究人员报道了一种用于在体内识别G-四链体相关蛋白(G4RP)的策略,该策略基于G4配体介导的交联反应并具有超高序列兼容性。
2)通过应用这一方法,研究人员分别在SV589和MM231细胞中识别出114和281种G4RP。研究结果成功覆盖了所有基于体外蛋白结合实验的文献报道。通过凝胶阻滞实验,研究人员还鉴别出一些新的G4RP。
3)强化交联和免疫共沉淀实验(eCLIP)验证了一种新发现的G4RP,即SERBP1,可以在细胞环境中与G4相互作用。
本文研究的新方法为发现细胞内与核酸二级结构相互作用的蛋白质提供了一个新的策略,并促进了对其生物学功能的研究。
参考文献:
Haomiao Su, et al. Photoactive G-Quadruplex Ligand Identifies Multiple G-Quadruplex-Related Proteins with Extensive Sequence Tolerance in the Cellular Environment. JACS, 2021.
DOI:10.1021/jacs.0c10792
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/jacs.0c10792