JACS:乙烯形成酶中的脱羧反应机理
纳米技术 纳米 2021-02-02

乙烯形成酶EFE是一种ambifunctional Fe/2OG加氧酶,在其中主要的EF反应中,能够将2OG中的1,2,5碳原子转化为CO2,3,4碳原子转化为乙烯,从而实现了4电子氧化反应,和其他各种类的Fe/2OG酶上进行的脱羧反应都不同。同时,EFE还能够催化一种副反应,将脱羧反应与L-精氨酸的氧化结合,从而生成L-谷氨酰胺半醛和胍。有鉴于此,宾州大学Amie K. Boal、Carsten Krebs、J. Martin Bollinger, Jr.等报道了L-精氨酸的氧化反应(RO)过程中经历了Fe(IV)-oxo(ferryl)中间体物种。作者通过5,5-[2H2]-L-Arg进行实验,发现ferryl分子的反应速率降低>16倍,说明RO的过程中首先在C5位点上进行HAT摘氢反应。作者发现较高的底物氘同位素效应对EF:RO的比例没有影响,说明ferryl中间体物种不会通过主要EF过程进行反应,因此反应过程肯定在更早的时候发生发散反应。

本文要点:

(1)

发现修饰了Asp191Glu配体的酶变体产生的ferryl复合物中间体累积量达到天然酶的4倍,在EF:RO的分配比例降低了40倍,这种对EF反应的选择性显著降低说明EF反应中需要不寻常的立体电子效应。其中活性位点与相同电荷的胍离子对,其中包括L-精氨酸底物/激发剂,而且能够作为稳定过渡态的选择性,形成独特的EF反应产物。

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参考文献

Rachelle A. Copeland, Katherine M. Davis, Tokufu Kent C. Shoda, Elizabeth J. Blaesi, Amie K. Boal,* Carsten Krebs,* and J. Martin Bollinger, Jr.,* An Iron(IV)−Oxo Intermediate Initiating LArginine Oxidation but Not Ethylene Production by the 2Oxoglutarate-Dependent Oxygenase, Ethylene-Forming Enzyme, J. Am. Chem. Soc. 2021,

DOI: 10.1021/jacs.0c10923

https://pubs.acs.org/doi/10.1021/jacs.0c10923


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