多聚ADP-核糖修饰蛋白质是DNA损伤反应的重要组成部分。四种PAR合成抑制剂最近被批准用于治疗乳腺癌、卵巢癌和前列腺癌。尽管PAR具有临床意义,但对其功能的分子理解,包括其结合伙伴,仍不完全。有鉴于此,美国霍普金斯大学的Anthony K. L. Leung和Marc M. Greenberg等研究人员,利用基于光亲和力的蛋白质组学鉴定多聚ADP-核糖结合蛋白。
本文要点
1)研究人员合成了一种能捕获和分离PAR结合物的PAR光亲和探针。该方法识别了数十种已知的PAR结合蛋白和数百种参与DNA修复、RNA处理和代谢的新候选蛋白。
2)通过pull-down和/或电泳迁移率分析确认了8个候选的PAR结合。
3)使用确定长度的PAR探针,研究人员检测到相比于8-mer优先结合40-mer的PAR的蛋白质,这表明聚合物的长度可能调节PAR信号通路的结果和时间。
本文研究首次对PAR结合蛋白进行了普查,提供了长度选择性PAR结合的蛋白质组学分析,并将PAR结合与RNA代谢和生物分子缩合物的形成联系起来。
参考文献:
Morgan Dasovich, et al. Identifying Poly(ADP-ribose)-Binding Proteins with Photoaffinity-Based Proteomics. JACS, 2020.
DOI:10.1021/jacs.0c12246
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/jacs.0c12246