RNA折纸是纳米支架模块化设计的框架，可以将其从RNA的单链上折叠起来，并用于设计组装纳米级精度的分子成分。基因可表达RNA折纸需要共转录地折叠，其设计需要同时考虑热力学、折叠路径、序列约束和伪结优化的建模和设计工具。有鉴于此，丹麦奥胡斯大学教授的Ebbe S. Andersen和美国加州理工大学的Paul W. K. Rothemund等研究人员，研究显示RNA折纸设计工具使千碱基大小的纳米支架能够进行共转录折叠。
本文要点
1）研究人员描述了RNA折纸自动化设计软件(ROAD)，该软件从结构模块库中构建折纸模型，识别潜在的折叠障碍并设计优化的序列。
2）利用ROAD，该课题组研究人员扩展了RNA支架的规模和功能多样性，创造了多达2360个核苷酸的32种设计，5种支架两个蛋白质，7种支架两个精确距离的小分子。
3）微观和色谱比较优化和非优化结构验证了他们的原则，链路由和序列设计大大提高了收率。
本文研究通过提供高效的RNA折纸设计，ROAD可以简化用于纳米医学和合成生物学的定制RNA支架的构建。
参考文献：
Cody Geary, et al. RNA origami design tools enable cotranscriptional folding of kilobase-sized nanoscaffolds. Nature Chemistry, 2021.
DOI：10.1038/s41557-021-00679-1
https://www.nature.com/articles/s41557-021-00679-1
