适用于临床的分子靶向疗法正在迅速发展,但其主要集中在改变基因组。转录组学分析为剖析肿瘤的复杂性提供了机会,其中包括肿瘤微环境(TME),它是影响癌症进展和治疗结果的关键介质。有鉴于此,美国BostonGene Nathan 的Fowler和Ravshan Ataullakhanov等研究人员,发现保守的泛癌微环境亚型可预测患者对免疫疗法的反应。
本文要点
1)通过对超过10,000名癌症患者的转录组进行TME分类,研究人员在20种不同癌症中鉴定到4种保守的TME亚型。
2)在多种癌症中,TME亚型与患者对免疫治疗的反应相关,拥有免疫反应性TME亚型的患者从免疫治疗中受益最大。
3)由于包含了恶性和微环境成分,TME亚型可作为许多癌症患者是否适用免疫治疗的生物标志物。
4)整合转录组学和基因组数据的可视化工具提供了完整的肿瘤图谱、描述了肿瘤结构、突变负荷、免疫组成、抗肿瘤免疫力和免疫抑制性逃逸的机制。
本文研究的整合分析加可视化可能有助于发现新的生物标记物和个性化治疗方案。
参考文献:
Alexander Bagaev, et al. Conserved pan-cancer microenvironment subtypes predict response to immunotherapy. Cancer Cell, 2021.
DOI:10.1016/j.ccell.2021.04.014
https://www.cell.com/cancer-cell/fulltext/S1535-6108(21)00222-1