1型糖尿病(T1D)的特点是胰岛内胰岛素分泌β细胞受到自身免疫攻击,这是由多种基因和环境因素驱动的。有鉴于此,英国牛津大学的John A. Todd等研究人员,揭示1型糖尿病的因果变异和药物靶点。
本文要点
1)研究人员报告了迄今为止最大和最多样化的1型糖尿病(T1D)遗传研究(61,427 名参与者),产生了78个全基因组显著(P<5×10-8)区域,其中包括36个新区域。
2)研究人员定义了可靠的T1D相关变异集,并表明它们富含免疫细胞可及的染色质,尤其是CD4+效应T细胞。
3)使用来自115名个体的CD4+T细胞染色质可及性分析,研究人员绘制出染色质可及性数量性状基因座并确定T1D风险变异与染色质可及性数量性状基因座共定位的五个区域。
4)结果表明,BACH2中的rs72928038是候选的T1D因果变体,并导致T细胞中增强子可及性和BACH2表达降低。
5)最后,通过整合遗传证据、功能基因组图谱和免疫蛋白-蛋白质相互作用,研究人员确定了12个与T1D相关的基因,这些基因已被用于自身免疫性疾病的临床试验,从而对潜在的药物靶点进行优先排序。
本文研究发现为T1D提供了拓展的基因组图谱。
参考文献:
Catherine C. Robertson, et al. Fine-mapping, trans-ancestral and genomic analyses identify causal variants, cells, genes and drug targets for type 1 diabetes. Nature Genetics, 2021.
DOI:10.1038/s41588-021-00880-5
https://www.nature.com/articles/s41588-021-00880-5