大脑内的基因调控模式在健康和疾病个体中存在高度动态调控，从而协调不同细胞类型之间的生物过程。有鉴于此，美国加州大学的Vivek Swarup等研究人员，研究揭示了阿尔茨海默病 (AD) 的单核染色质可及性和转录组学特征。

本文要点

1）研究人员报道了针对晚期阿尔茨海默病个体191,890个细胞核的多组学单核研究，分析相同生物样本中的染色质可及性和基因表达，并揭示了明显的细胞异质性；这些结果可通过网站获得。

2）研究人员确定了细胞类型特异性、疾病相关的候选顺式调控元件及其候选靶基因，包括一个由APOE和CLU连接的少突胶质细胞相关调控模块。

3）研究人员通过全基因组关联研究确定了AD风险位点子集中特定细胞类型的顺式调节关系，证明了这种单核多组学方法的实用性。胶质细胞群的轨迹分析确定了与疾病相关的转录因子，如 SREBF1，及其靶基因。

4）最后，研究人员采用了单核一致加权基因共表达分析方法对AD转录组进行系统级分析，这是一种对分散单细胞数据共表达网络的分析策略。

参考文献：

Samuel Morabito, et al. Single-nucleus chromatin accessibility and transcriptomic characterization of Alzheimer’s disease. Nature Genetics, 2021.

DOI：10.1038/s41588-021-00894-z

https://www.nature.com/articles/s41588-021-00894-z