携带特定位置标记的组蛋白和带有一般标记的组蛋白之间的组蛋白交换对于基因调控很重要,但对组蛋白交换的理解仍然不完整。有鉴于此,以色列魏茨曼科学研究所的Naama Barkai和Gilad Yaakov等研究人员,用酵母中的基因编码交换计时器测量组蛋白置换动力学。
本文要点
1)研究人员为了克服传统脉冲追踪组蛋白标记较差的时间分辨率问题,提出了一种基因编码的组蛋白交换计时器,该计时器对两个标记的组蛋白亚基共同驻留在单个基因组位点的持续时间敏感。
2)研究人员将这些传感器应用于单个样本绘制的酵母组蛋白交换的全基因组模式。
3)比较循环和 G1 停滞细胞中的 H3 交换表明,每分钟数百个核小体(<所有核小体的 1%)发生独立于复制的 H3 交换,组蛋白启动子的速率最大。
4)研究人员观察到两个核小体核心亚复合体之间的显著差异:H2A-H2B 亚复合体在编码区域内经历快速转录依赖性替换,而 H3-H4 替换主要发生在启动子核小体内,与基因激活或抑制相关。
本文研究的计时器允许以分钟的时间尺度分辨率对组蛋白交换动力学进行体内研究。
参考文献:
Gilad Yaakov, et al. Measurement of histone replacement dynamics with genetically encoded exchange timers in yeast. Nature Biotechnology, 2021.
DOI:10.1038/s41587-021-00959-8
https://www.nature.com/articles/s41587-021-00959-8