癌症中复杂的基因组扩增演变背后的机制在很大程度上仍不清楚。有鉴于此,德国科隆大学的Matthias Fischer、Martin Peifer等研究人员,发现染色体碎裂与循环重组驱动人类癌症中的癌基因扩增。
本文要点
1)研究人员利用小儿肿瘤神经母细胞瘤的全基因组测序数据,发现了一种扩增类型,称为"地震式扩增",其特点是多重排和不连续的拷贝数水平。
2)总的来说,地震式扩增发生在38种癌症类型的9.9%病例中(2,756例中的274例),并与大量增加的拷贝数和升高的癌基因表达有关。
3)地震式扩增的发育重建显示了一个逐步演变的过程,首先是染色体脱落事件,然后是形成环状染色体外DNA,随后经历了反复的循环重组。
4)由此产生的扩增子作为染色体外DNA环持续存在,或者已经重新整合到明显的肿瘤的基因组中。
本文研究表明,在相当一部分人类恶性肿瘤中,染色体缺失和循环重组的相继发生推动了肿瘤基因的扩增和过度表达。
参考文献:
Carolina Rosswog,et al. Chromothripsis followed by circular recombination drives oncogene amplification in human cancer. Nature Genetics, 2021.
DOI:10.1038/s41588-021-00951-7
https://www.nature.com/articles/s41588-021-00951-7