尽管抗原特异性对T细胞功能至关重要,但由于技术上的难度,在基于多组学的高通量T细胞分析中常常被省略。有鉴于此,美国德克萨斯大学奥斯汀分校的Ning Jiang等研究人员,实现抗原特异性CD8+ T细胞的高通量和高维度单细胞分析。
本文要点
1)研究人员报道了一种高维的、与四聚体相关的T细胞抗原受体(TCR)测序(TetTCR-SeqHD)方法,其可同时对数万个单细胞的同源抗原特异性、TCR序列、目标基因表达和表面蛋白表达进行分析。
2)使用具有已知抗原特异性和TCR序列的人类多克隆CD8+ T细胞,研究人员证明了检测正确抗原特异性的精确度超过98%。
3)研究人员还评估了抗原特异性CD8+ T细胞的基因表达和表型差异,并描述了流感和Epstein-Barr病毒特异性CD8+ T细胞的表型特征,这些特征对其病原体靶标是独一无二的。
4)由于具有同时分析数百种抗原的高通量能力,研究人员应用TetTCR-SeqHD来鉴别了1型糖尿病患者与健康对照组相比优先富集于同源CD8+ T细胞的抗原,并发现一种与糖尿病相关和微生物组抗原交叉反应的TCR。
本文研究的TetTCR-SeqHD是剖析人类和小鼠T细胞反应的一种强大方法。
参考文献:
Ke-Yue Ma, et al. High-throughput and high-dimensional single-cell analysis of antigen-specific CD8+ T cells. Nature Immunology, 2021.
DOI:10.1038/s41590-021-01073-2
https://www.nature.com/articles/s41590-021-01073-2