尽管在成像方面取得了进步,但基于图像的血管系统生物学仍然具有挑战性,因为血管数据通常只能从单一模态或给定的空间尺度获得,而跨模态数据难以整合。因此,迫切需要一种多模态管道,该管道能够通过磁共振成像、计算机断层扫描和光学显微镜对同一样本进行离体血管成像,同时允许使用从整个器官到内皮细胞空间尺度的互补对比机制进行成像。有鉴于此,美国约翰霍普金斯大学医学院的Arvind P. Pathak等研究人员,开发了VascuViz,一种用于血管系统生物学的多模态和多尺度成像和可视化管道。
本文要点
1)研究人员开发了“VascuViz”——一种易于使用的方法,用于在同一完整、未切片的组织中使用磁共振成像、计算机断层扫描和光学显微镜同时对血管微环境进行三维成像和可视化。
2)VascuViz 工作流程允许使用商业试剂通过单一标记步骤进行多模式成像,并且与多种组织类型和协议兼容。
本文研究的VascuViz 实现了跨学科实用程序与新的数据可视化方法相结合,为基于图像的血管系统生物学开辟了新的前景。
参考文献:
Akanksha Bhargava, et al. VascuViz: a multimodality and multiscale imaging and visualization pipeline for vascular systems biology. Nature Methods, 2022.
DOI:10.1038/s41592-021-01363-5
https://www.nature.com/articles/s41592-021-01363-5