考虑到不同的单核苷酸多态性(SNP)组合可能产生不同的表型结果,分析基因组中复杂的SNP组合对于研究和临床应用非常重要。最近的研究表明,基于DNA的分子计算能够同时感知和分析复杂的分子信息。有鉴于此,上海交通大学的韩达、Yang Yang等研究人员,使用可编程DNA分子计算对多单核苷酸多态性进行逻辑分析用于临床诊断。
本文要点
1)研究人员设计了一种基于开关电路的DNA计算方案,可以集成多个SNP的感知,同时对检测到的SNP信息进行逻辑分析,以直接报告临床结果。
2)研究人员成功地从83份临床血液样本中自动准确地识别了21种不同的血型基因型,与测序数据相比,准确率为100%(3小时)。
本文研究方法为临床诊断和指导个性化用药提供了一种自动、逻辑传感和分析细微分子信息的新模式。
参考文献:
Da Han, et al. Logical Analysis of Multiple Single-Nucleotide-Polymorphisms with Programmable DNA Molecular Computation for Clinical Diagnostics. Angew, 2022.
DOI:10.1002/anie.202117658
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/anie.202117658