了解HIV-1感染的CD4⁺ T细胞克隆性扩增的驱动因素和标志物对HIV-1的根除至关重要。有鉴于此，美国耶鲁大学医学院的Ya-Chi Ho等研究人员，利用单细胞多组学揭示HIV-1在扩增的细胞毒性T细胞克隆中的持久性。

本文要点

1）研究人员使用了单细胞ECCITE-seq，它在同一单细胞内捕获表面蛋白表达、细胞转录组、HIV-1 RNA和TCR序列，来追踪了6个HIV-1感染者（病毒感染期间和抑制性抗逆转录病毒治疗后）和2个未感染者的纵向存档样本的克隆扩增动态，这些样本是在未刺激条件下和CMV和HIV-1抗原刺激后。

2）尽管进行了抗逆转录病毒治疗，持续的抗原和TNF反应形成了T细胞的克隆扩增。

3）HIV-1驻留在Th1极化、抗原反应的T细胞中，表达BCL2和SERPINB9，可能抵抗细胞死亡。

4）HIV-1 RNA⁺的T细胞克隆大小较大，在病毒感染期间建立，在病毒抑制后持续存在，并富含GZMB⁺细胞毒性效应记忆Th1细胞。

本文研究表明，靶向HIV-1感染的细胞毒性CD4⁺ T细胞和克隆扩增的驱动因素为HIV-1的根除提供了另一个方向。

参考文献：

Jack A. Collora, et al. Single-cell multiomics reveals persistence of HIV-1 in expanded cytotoxic T cell clones. Immunity, 2022.

DOI：10.1016/j.immuni.2022.03.004

https://www.cell.com/immunity/fulltext/S1074-7613(22)00127-3