Nature Methods:检测和校正钙成像中的错误瞬变
先知报道 先知报道 2022-04-17

钙活动的人口记录是洞察神经功能的主要来源。大型数据集需要自动处理,但这可能会引入难以检测的错误。有鉴于此,美国约翰霍普金斯大学的Adam S. Charles和美国普林斯顿大学的David W. Tank等研究人员,合作检测和校正钙成像中的错误瞬变。

 

本文要点

1研究人员证明了,流行的时间过程估计算法通常包含影响 10-20% 瞬态的大量归因错误。

2当重叠的细胞和过程定义不完善或未识别时,就会出现错误归因,即荧光归因于错误的细胞。

3为了诊断错误归因,研究人员开发了用于评估大型数据集的指标和可视化工具。

4为了纠正时间过程,研究人员引入了一个强大的估计器,它明确地解释了污染信号。

5在一个海马数据集中,去除污染使位置细胞数量减少了 15%,19% 的位置场移动了 10cm 以上。

本文研究的方法与其他细胞发现技术兼容,使用户能够诊断和纠正可能改变科学结论的潜在广泛问题。

 

                                             


参考文献:

Jeffrey L. Gauthier, et al. Detecting and correcting false transients in calcium imaging. Nature Methods, 2022.

DOI:10.1038/s41592-022-01422-5

https://www.nature.com/articles/s41592-022-01422-5


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