大连理工大学刘猛教授首次通过体外选择的方法,从随机序列DNA库中分离得到酸性RNA剪切DNA酶(aRCDs),其能够在pH=5.3的条件下被微生物大肠杆菌(E. coli)激活。
本文要点:
(1)这些对大肠杆菌敏感的aRCDs只需要将单价金属离子作为辅助因子就能够剪切荧光嵌合DNA/RNA底物。这种特性能够有效地保护RCDs免受其化学不稳定性和外部酶降解等作用的影响。研究发现,DNA酶(aRCD-EC1)对大肠杆菌具有特异性,其靶点是一种蛋白质。此外,截短的aRCD-EC1具有显著提高的催化活性,速率常数(kobs)为1.18 min-1,是迄今为止最快的细菌响应RCD。
(2)对40例患者尿液样本的临床评估结果表明,在不进行细菌培养以及总分析时间为50 min时,这种基于aRCD的荧光检测方法的诊断灵敏度为100%,特异性为100%。综上所述,这项研究工作进一步丰富了在非生理条件下具有活性的DNA酶库,有望推动基于DNA酶的生物传感器在临床诊断中的应用。
Qinbin Zhou. et al. In Vitro Selection of M2+-Independent, Fast-Responding Acidic Deoxyribozymes for Bacterial Detection. Journal of the American Chemical Society. 2023
DOI: 10.1021/jacs.3c06155
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/jacs.3c06155