严重急性呼吸综合征冠状病毒 2 (SARS-CoV-2) 的演变突出了对能够区分新出现的病毒变体的多功能诊断分析的需求。然而,目前,允许我们快速解决 SARS-CoV-2 突变以识别其变体的工具并不容易获得。用于 SARS-CoV-2 变体的可扩展筛选工具理想情况下应 (i) 允许检测病毒 RNA 中的单核苷酸突变,(ii) 提供较短的样本到结果的时间,以及 (iii) 提供多路复用能力以识别多种变体。
鉴于此,清华大学李景虹院士联合四川大学李为民教授、邓锐杰副教授等人报告了一种廉价(每次测试约 0.30 美元(约2块钱人民币))检测的开发和性能基准测试,用于快速(30 min 内的样本到答案时间)比色检测SARS-CoV-2 变体。
研究人员将其整合到可折叠纸条中的分析利用了核酸链置换反应、与单碱基对错配相关的热力学能量损失和金属离子控制的尿素酶切来放大对病毒RNA的识别,以便通过智能手机比色读出pH值的变化。
对于50份咽拭子样本,该测定同时检测到 SARS-CoV-2 的存在以及SARS-CoV-2变体α、β和γ的特异性突变,与实时定量聚合酶链反应和RNA测序完全一致。用于检测病毒及其变体的可定制且廉价的纸质化验可能有助于病毒监测。
研究人员还开发了一个智能手机应用程序(应用程序)来指导诊断,并可视化和记录临床和冷链食品样品的测试结果。
参考文献:
Zhang, T., Deng, R., Wang, Y. et al. A paper-based assay for the colorimetric detection of SARS-CoV-2 variants at single-nucleotide resolution. Nat. Biomed. Eng (2022).
https://doi.org/10.1038/s41551-022-00907-0