检测单核苷酸多态性(SNPs)等基因突变对于制定有效的癌症治疗方案、进行基因分析和区分类似病毒株具有重要意义。传统的SNP检测使用差异结合SNP和野生型靶标的短寡核苷酸探针。然而,基于DNA杂化的技术需要精确调节探针的亲和力,以调节特异性和敏感性之间的内在权衡。由于传统杂化对亲和力的控制有限,因此埃默里大学Khalid Salaita报道了异源多价DNA功能化颗粒,其对含有一个或两个突变的靶标表现出优异的杂化特异性。
本文要点:
1) 通过研究寡聚体长度、间隔体长度和结合方向的作用,作者发现异源多价杂化能够微调单个SNP的特异性,并通过高度协同结合显著增强两个非近端SNP的特异性。
2) 利用这些性质,作者证明了顺式和反式突变之间以及不同SARS-CoV-2毒株之间的直接区别。该研究表明,与传统的单价杂化方法相比,异源多价杂化提供了实质性的改进。
Brendan R. Deal et.al Heteromultivalency enables enhanced detection of nucleic acid mutations Nature Chemistry 2023
DOI: 10.1038/s41557-023-01345-4
https://doi.org/10.1038/s41557-023-01345-4