PNAS:MEnTaT:一种用于识别突变以提高蛋白质稳定性的机器学习方法
NavyLIu NavyLIu 2023-12-04

image.png提高蛋白质的热稳定性对于生物医学和工业应用以及实验研究都很重要。在这里,波士顿大学Karen N. AllenAdrian Whitty描述了一种简单的机器学习方法,该方法基于在不同温度下生长的细菌衍生的同源蛋白质的氨基酸序列的比较来识别有助于热稳定性的氨基酸取代。

 

本文要点:

1) 该方法的一个关键特征是,它不仅基于氨基酸同一性,而且基于侧链的结构和物理化学性质来比较序列。该方法在三个研究系统中准确鉴定了稳定取代,并通过实验测试多胺氧化酶中预测的稳定取代进行验证。

2) 在每种情况下,该方法都优于广泛使用的生物信息学共识方法。该方法还可以提供对蛋白质结构的深入了解,例如,识别给定蛋白质中有多少序列位置与温度适应相关。

 

参考文献:

Samantha N. Muellers et.al MEnTaT: A machine-learning approach for the identification of mutations to increase protein stability PNAS 2023

DOI: 10.1073/pnas.2309884120

https://doi.org/10.1073/pnas.2309884120


加载更多
791

版权声明:

1) 本文仅代表原作者观点,不代表本平台立场,请批判性阅读! 2) 本文内容若存在版权问题,请联系我们及时处理。 3) 除特别说明,本文版权归纳米人工作室所有,翻版必究!
NavyLIu

燃料电池电极催化反应催化剂及动力学反应机理

发布文章:3745篇 阅读次数:1709789
纳米人
你好测试
copryright 2016 纳米人 闽ICP备16031428号-1

关注公众号